Transcriptoma Espacial

Perguntas frequentes: Transcriptoma Espacial

1. O que é Transcriptoma Espacial e para que serve?

Transcriptoma Espacial é uma técnica que permite mapear a expressão gênica diretamente no tecido, mostrando onde cada gene está ativo. Ela serve para identificar heterogeneidade celular, entender microambientes tumorais e revelar padrões biológicos impossíveis de ver na transcriptômica tradicional.

Em quais áreas a Transcriptoma Espacial é mais usada?

• Câncer;
• Neurociência;
• Imunologia;
• Desenvolvimento de fármacos;
• Estudos de tecidos FFPE.

2. Como funciona a tecnologia de Transcriptoma Espacial?

A técnica de Transcriptoma Espacial combina captura de RNA em regiões específicas do tecido com sequenciamento de alta resolução.

3. Qual a diferença entre transcriptômica tradicional e Transcriptoma Espacial?

A transcriptômica tradicional (bulk ou single-cell) mostra quais genes estão sendo expressos, mas perde a localização das células no tecido.

 Já o Transcriptoma Espacial preserva o contexto anatômico, permitindo análises como:

• Interações célula–célula;
• Gradientes de expressão;
• Identificação de nichos tumorais;
• Mapeamento de regiões inflamatórias.
  

Ou seja: a mesma quantidade de dados, com muito mais contexto.

4. Transcriptoma Espacial funciona em tecidos FFPE?

Sim, tecnologias como 10x Genomics Spatial Gene Expression (v1, v2 e HD) e Spatial Gene + Protein são compatíveis com FFPE.

Isso permite que laboratórios usem amostras arquivadas, o que acelera pesquisas clínicas e estudos retrospectivos.