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Kits Chromium Single Cell ATAC – 10X Genomics

O ensaio Chromium Single Cell ATAC (Assay for Transposase Accessible Chromatin) permite o mapeamento do epigenoma em resolução de célula única. Utilizando uma enzima transposase para preferencialmente marcar regiões acessíveis de DNA com adaptadores de sequenciamento, é possível gerar bibliotecas para identificação de regiões abertas de cromatina. O fluxo de trabalho simplificado, combinado com os softwares intuitivos, possibilita a compreensão de mecanismos epigenéticos e regulatórios de dezenas de milhares de células.

Com os kits de ensaio Chromium Single Cell ATAC é possível analisar regiões abertas de cromatina com resolução de célula única, permitindo uma compreensão maior da heterogeneidade epigenética celular; obter o perfil epigenético de centenas a dezenas de milhares de núcleos, possibilitando a obtenção de dados de células raras; examinar sequências não-codificadoras permitindo a descoberta de elementos regulatórios cis e que possam estar envolvidos em diferenças na regulação da expressão gênica entre tipos e estados celulares; seguir um fluxo de trabalho simples e robusto com protocolos previamente testados para diferentes tipos de amostras, incluindo linhagens celulares, células primárias e tecidos frescos congelados; utilizar os softwares da 10x Genomics para analisar e visualizar os dados de Single Cell ATAC. Os kits permitem particionar de 500 a 10.000 núcleos por canal e processar até 80.000 núcleos por corrida e até 8 amostras em paralelo. As taxas de captura são altas, de aproximadamente 65% e as taxas de multiplets são baixas (mais de uma célula por partição) – 0,8% para 1.000 células.

Especificações Técnicas:

Consulte-nos para especificações técnicas e opções de kits.

Segmento

Fabricante

Aplicação

Tipo

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