A ATCC é a principal fonte de materiais de referência microbiana e utiliza os mais altos padrões na produção de material de qualidade. Os pesquisadores da ATCC coletaram, autenticaram e preservaram microrganismos por quase um século para garantir acesso às cepas necessárias no desenvolvimento de terapêuticos, vacinas, produtos ambientais e de garantia e qualidade de alimentos e água. A coleção da ATCC apresenta bactérias e Archaea de interesse clínico e ambiental, incluindo cepas resistentes a drogas e extremófilas. Inclui também uma coleção de protistas e protozoários parasistas taxonomicamente válidos, uma variedade diversificada de fungos filamentosos e leveduras com aplicação em genética, controle de qualidade e medicina, além de tipos de vírus de animais e plantas.